Połączenie Akademii Medycznej i Uniwersytetu Mikołaja Kopernika rozpoczęło się od przyjęcia przez Senat RP ustawy. Umowa została podpisana 24 listopada 2004 roku. Równocześnie władze obu placówek przebywały razem w Watykanie. To właśnie tam uroczyście przyznano tytuł doktora honoris causa papieżowi Polakowi. Należy zaznaczyć, że również w tym roku świętowana jest 30. rocznica utworzenia Akademii Medycznej w Bydgoszczy.Podczas uroczystego posiedzenia władz uczelni odbyły się liczne wystąpienia, czy wykłady. Nie zabrakło także części podczas której zostały wręczone nagrody Rektora UMK. Spotkanie zakończył występ uczelnianego chóru. Z okazji jubileuszu zdecydowano także, że absolwenci AM w Bydgoszczy będą mogły przystąpić do programu „Absolwent UMK”.